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使用PubCrawler:如何通過爬行加快你的文獻搜索

一個男性遊泳前爬的圖像代表Pubcrawler工具

想知道PubCrawler如何為你的文學評論節省寶貴的時間嗎?繼續閱讀…

這通常看起來像是一份全職工作PubMed的最新論文關於成人神經發生,導致癌症的激酶基因突變,或者你所在領域的重要人物發表的最新論文。然而,落後於最新發表的研究也可能是壓力的一個重要來源。

尋找圖書館助理

當我還是一名研究生時,我會勤奮地在PubMed上搜索關於我當時最喜歡的蛋白質TrkB和我最喜歡的科學家Marc Tessier-Lavigne的最新文章。

然而,考慮到研究生院在實驗科學方麵的要求,要定期跟上你最喜歡的子搜索是很困難的。“要是有什麼東西能自動為我做這些定期搜索,然後簡單地用電子郵件發給我就好了,”我想。

事實證明,它確實存在。

PubCrawler是由愛爾蘭都柏林三一學院遺傳學係的Karsten Hokamp和Ken Wolfe開發的一種基於網絡的免費服務。自1999年以來,它一直在幫助加速科學家的文獻搜索。

PubCrawler會自動搜索PubMed和GenBank,查找您指定的基於文本的查詢,並將結果通過電子郵件發送給您。有什麼理由不喜歡呢?

注冊帳戶後,您可以通過多種方式自定義搜索查詢,包括PubMed提供的搜索查詢(作者、標題詞、文本/摘要關鍵詞、MeSH術語、期刊、出版範圍等)。

您還可以選擇您的搜索結果以何種頻率被電子郵件發送給您,以及您希望在每周的哪一天(和時間!)收到它們。

雖然PubCrawler不是最漂亮的網站,但外觀並不能代表一切,它仍然是我在自己的領域保持領先的一個絕對重要的部分。任何能幫助你穿過每周出版的大量新文學作品的東西都是一件好事!

如何使用PubCrawler為你去圖書館

例如,假設你想了解Fred Gage(成人神經發生領域的傑出人物)最新發表的研究成果。

隻需使用“Gage FH”作為搜索詞構造一個新的查詢,並使用“搜索字段”下拉菜單選擇“作者”。

點擊“完成!”按鈕在頁麵底部,你現在會收到郵件每當Fred Gage發表了一篇新論文根據你設置的頻率和時間:

圖1 pubcrawler
使用PubCrawler:如何通過爬行加快你的文獻搜索

您可以通過PubCrawler設置的搜索查詢與直接搜索PubMed的搜索查詢一樣多樣。例如,你可能還想知道什麼時候發表了關於NMDA受體在記憶中的作用的論文。

為此,隻需在一個方框中使用“NMDA受體”作為搜索詞,在下麵的搜索詞中使用“記憶”。

圖3 pubcrawler

選擇“and”作為連接器,以確保PubCrawler返回具有這兩個術語的論文(在本例中,合格的返回必須在論文的標題或摘要中包含每個術語,但您可以將其限製為隻包含標題,也可以將其擴大以檢索文本中任何地方包含所選術語的論文)。

通過使用搜索詞的組合,您可以創建自定義查詢,隻交付您想要的論文!

使用PubCrawler:如何通過爬行加快你的文獻搜索

一個更完整的教程可以在這裏找到

如果你恰好同意PubCrawler的口號(“去圖書館-你去酒吧”),那麼設置一係列查詢絕對是以最有效的方式保持在你所在領域的文獻頂端的重要部分!

我建議將它與其他RSS提要以及etoc一起使用,以確保您不會錯過任何內容。

你是PubCrawler的粉絲嗎?我們很想知道它是如何幫助你的;請在下方留言!

想了解更多了解科學文獻的方法,請訪問118bet金博宝下载

最初發布於2016年7月9日。2021年11月審查並更新。

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1評論

  1. 馬克福特納 2016年2月2日淩晨5點57分

    你為什麼不直接用myncbi呢。它具有與電子郵件或RSS相同的功能,可以讓您獲得預定的結果。



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