如何不錯過(幾乎)PubMed上的任何文章
閱讀論文(仍然)仍然是跟蹤我們領域進展的標準方式,跟蹤我們的合作者/競爭對手,或者享受一些離題但科學有趣的時刻。作為科學家,我們無時無刻不在閱讀。然而,閱讀可能會成為一種高度隨時間變化的活動,特別是當我們需要同時進行實驗、參加會議和撰寫撥款申請時。
為了簡化我們的閱讀活動,理想的情況是我們現在就在那裏一有我們感興趣的文章發表就通知。好吧,這種理想的情況確實存在,並且已經存在了很長一段時間:自2005年6月以來,PubMed搜索結果可以生成為RSS提要(1).
在這裏,我將描述我的組合方式RSS提要為PubMed搜索結果穀歌閱讀器和一個GreaseMonkey擴展為了獲得一份與我個人興趣相關的可讀性很好的文章列表(圖1).
圖1:PubMed RSS提要,在GoogleReader中,帶有彩色列表視圖插件。每次PubMed搜索都以一種特定的顏色顯示。你很容易猜到我自己的興趣是什麼。 |
注意:你可能已經熟悉PubMed搜索郵件提醒,因為它們最近在BitesizeBio(2)上被描述過。就我個人而言,我發現這種方法有可能進一步膨脹你已經快要爆炸的電子郵件收件箱。
過程
你需要的:
- 以前的知識,如何微調PubMed搜索
- 穀歌賬號,用GoogleReader啟用
- 的GreaseMonkeyFirefox插件
- 的穀歌閱讀器彩色列表視圖GreaseMonkey插件
你需要做的是:
一旦你熟悉了PubMed搜索,設置一個GoogleReader帳戶,安裝GreaseMonkey插件,然後安裝穀歌Reader彩色列表視圖(呸…),你可以1-認為自己是一個嚴肅的極客,2-通過以下步驟來設置你的閱讀列表。
1-執行(相關的)PubMed搜索
我們都知道如何搜索PubMed:不需要注冊,也不需要登錄。隻是搜索。
注意:PubMed搜索對單數/複數、虛線/非虛線等細節非常敏感。
2-從PubMed搜索生成一個RSS提要
一旦執行了相關的PubMed搜索,就需要從中生成一個RSS提要。要做到這一點,請單擊PubMed搜索欄(圖2一個).
會彈出一個小窗口:設置顯示條目的數量(我通常將其設置為最大值(100)以獲得最多的結果),更改提要標題(稍後在GoogleReader中也可以這樣做),然後單擊“創建RSS”按鈕。將出現一個XML圖標(圖2 b):點擊它。
圖2A: RSS提要圖標和菜單。 |
圖2B:指向XML文件的RSS提要鏈接。 |
將打開一個新窗口(圖3):您可能會看到不同的內容,這取決於您的瀏覽器。無論顯示的是什麼,複製RSS提要URL(看起來應該像這樣:http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/erss.cgi?rss_guid=#####)。
圖3:XML文件的一種可能顯示方式。我們隻需要複製瀏覽器地址欄中的URL。 |
注意:你也可以在PubMed幫助頁(3)的教程部分找到如何從PubMed搜索生成RSS提要的動畫過程。
3-導入RSS提要到GoogleReader
一旦你生成了一個RSS提要,你需要將它導入到GoogleReader中。要做到這一點,請在GoogleReader中創建一個新的訂閱,粘貼先前複製的RSS提要URL,然後單擊“添加”(圖4一).
GoogleReader將自動更新其顯示,PubMed搜索結果將出現(圖4 b).它還會在RSS提要更新時自動更新,即每次發布符合您設置的標準的新文章。你現在唯一要做的就是瀏覽文章。
圖4A: GoogleReader中新的RSS訂閱。您所需要做的就是將URL粘貼到訂閱欄中。 |
圖4B:在GoogleReader中即時顯示PubMed結果。現在您已經完成了所有的技術考慮。 |
你可以通過GoogleReader設置(我不打算在這裏討論)來更改顯示。GoogleReader還有許多其他有趣的功能(標記、標簽、電子郵件等),你可能想自己探索一下。
注意:GreaseMonkey的彩色列表視圖插件允許每個RSS提要以特定的顏色顯示(圖1)。這大大增加了文章列表的可讀性,特別是當您積累了許多不同的RSS提要時。
優勢與局限性
一旦你嚐試過這個係統並習慣了GoogleReader的功能,我想它的優勢就會變得非常明顯。當然也有一些限製,盡管我懷疑隨著你使用PubMed搜索的技能的提高,這些限製將會消失。
優點:
- 自動實時更新已發表文章。
- 瀏覽速度快,易於閱讀,易於組織。
- 收件箱裏沒有電子郵件。
- GoogleReader功能:你可以標記、標記、分享等等。隻管玩它。
限製:
- 如果你的PubMed搜索過於嚴格,有丟失文章的風險。
- 如果你的PubMed搜索不夠嚴格,你可能會被大量文章淹沒。
- 不再瀏覽PubMed的風險,這可能意味著錯過一些有趣的,雖然不相關的論文。
我希望您覺得這個技巧有用或有趣。請在評論區告訴我們你的想法!
參考文獻
(1) Canese, K。從PubMed®提供RSS提要。NLM技術公牛,2005年5月- 6月;(344):e2。
(2) Magub, S。設置PubMed警報3個簡單的步驟。BitesizeBio。2012.
(3) RSS。PubMed教程。NLM /國家衛生研究院。2011年3月。