豐富多彩的測序成功的路線

生物上的一再格言科學,任何實驗隻是一樣好控製。控製是一個不變的標準比較在一個實驗中,和一個內部控製通常是一個標準的反應運行與測試反應在同一反應混合物。內部控製的目的是最小化的影響無關的元素或變量。內部控製的使用增加結果的準確性和可靠性,在高通量分析是必不可少的,容易出錯。

大部分的內部控製所麵臨的問題是,它們終點控製。這種類型的控製並告訴你是否測試反應是表現最佳,但他們隻有這樣做最後的實驗。這並不理想,尤其是在高通量測序研究,涉及昂貴的試劑,和珍貴的(有時不可替代)的DNA樣本。理想的內部控製會告訴你你繼續下一步之前過程中執行的反應你是否成功。

在老圖書館準備的DNA試劑盒主要缺點全基因組測序(WGS)缺乏實時進程內反饋。準備一個圖書館從DNA分離新鮮或存儲組織樣本包括多個步驟清晰透明的液體微量的反複分發成大量的小容器。這些微妙的所需的高水平的準確性和精確動作的概率增加的錯誤導致實驗失敗。明顯的顏色跟蹤染料中英傑公司™Collibri™PCR-Free PS DNA庫準備裝備Illumina公司係統和英傑公司Collibri PS DNA庫預備Illumina公司係統的工具提供視覺反饋,允許實時跟蹤的每一步成功的混合試劑在圖書館準備和量化WGS工作流。追蹤染料不需要任何複雜的測量或耗時的彎路,因為反饋是肉眼可見的。

大多數WGS工作流中的錯誤出現在涉及液體處理的步驟。甚至自動化液體處理的概率並不排除錯誤和受益於豐富多彩的提供的視覺反饋追蹤染料。DNA庫Illumina公司HiSeq™和NovaSeq^™係統通常是準備在96年好格式,方便追蹤染料作為內部控製的使用是特別有用。液體處理發生錯誤時井得不到適量的液體試劑或當新添加試劑不均勻混合的解決方案已經好了,導致次優或失敗的反應。

在單井的顏色差距很容易和立即檢測到大量的樣品沒有任何耗時的測量或額外的測試步驟。例如,英傑公司Collibri DNA庫準備裝備組合,在增加無色透明分散DNA轉換Mastermix結束時,這是一個深沉的藍綠色,出現一個很容易被淡藍色的解決方案的視覺提示信號的調查員成功完成這一步。接下來,淺藍色的樣品溶液從這一步是添加到dual-indexed適配器,貼上明顯黃色追蹤染料,導致綠色DNA-Adaptor混合。在任何一步,沒有五彩繽紛的提示研究者警告說,一個沒有添加到樣本或試劑的試劑還沒有徹底混合。這種直接的視覺提示很容易檢測一瞥甚至在96孔板。

顏色差異調查人員暫停的視覺提示,添加所需的試劑或更徹底地混合試劑在錯誤的示例。研究者可以繼續下一步,相信最後一步已經圓滿完成。充滿活力的明顯線索追蹤染料在每個階段工作流程避免代價高昂的錯誤,保證測序成功。