破壞瓊脂糖凝膠以及如何避免它們的5種方法！

瓊脂糖凝膠通常用於基於它們的大小，單獨的DNA和RNA分子。在大多數生物學實驗室中，這是一種常用的技術，盡管倒入和運行瓊脂糖凝膠應該是一個簡單而常規的過程，但您可以犯一些令人驚訝的瓊脂糖凝膠錯誤。

這是瓊脂糖凝膠電泳的五個常見罪魁禍首，以及如何避免這些新秀錯誤！

前5個瓊脂糖凝膠錯誤

1.使用水而不是緩衝液作為凝膠或運行緩衝液

使用TAE或TBE緩衝液鑄造和運行瓊脂糖凝膠。由於兩個緩衝液都是透明的液體，因此很容易將它們誤認為水。如果使用水，將電荷塗在凝膠盒中後不久將融化，以告別那些珍貴的DNA樣品！

正如一位評論者所提到的那樣，您也不想意外使用過於集中的緩衝區。因此，請確保在添加之前正確稀釋該5倍TAE！

選擇正確的緩衝區也很重要。因此，請確保這些瓶子被清楚地標記，並且您可以輕鬆避免電泳中的簡單錯誤。

2.忘記在瓊脂糖凝膠中添加溴化乙錠（或其他DNA/RNA染色）

匆忙，很容易忘記在鑄造凝膠之前，在瓊脂糖中添加溴化乙錠。當然，沒有它，就不可能可視化您的DNA。幸運的是，您可以通過將其浸泡在含有乙錠的緩衝液中來營救未染色的凝膠。

實際上，有些人甚至更喜歡以後弄髒它，盡管您會有大量的溴化乙錠廢物處置（幸運的是，它可以重複使用幾次，然後才能擺脫它）。

當然，其他汙漬可用。查看此方便的指南。

3.使用瓊脂糖的錯誤百分比（或類型）

用於分離DNA的瓊脂糖的標準百分比為1.0％。在凝膠中使用較高百分比的瓊脂糖可以增強較小帶的分辨率。相比之下，較低的瓊脂糖百分比使較小的頻帶可以快速通過凝膠，從而為您提供更好的分辨率和較大帶的分離。

如果使用錯誤的百分比，則很難可視化您的樂隊。當使用低於0.8％的瓊脂糖百分比時，請注意，因為這些凝膠會變得較弱，並且更容易破裂。

低熔點瓊脂糖可用於專門應用，例如凝膠結紮。[1]即使以可比的百分比，這些凝膠也非常“湯”和脆弱，因此，請確保在混合一批瓊脂糖之前抓住合適的試劑。

4.將導線從電源混合

最令人沮喪的（但最簡單！）的錯誤之一是意外地從電源轉換鉛，以使凝膠向後運行。

由於井非常接近凝膠的末端，因此，如果您不立即注意到錯誤，您很可能會丟失所有樣本。

在開始電泳的前幾分鍾內閑逛並檢查凝膠並不是一個壞習慣，這也使您有機會確保有電流流動（很容易通過電極的氣泡驗證）。

因此，如果您注意到樂隊在為時已晚之前朝錯誤的方向前進，隻需切換線索並以另一種方式運行。

5.在去成像儀的路上掉下瓊脂糖凝膠

認真的 - 不要讓這種情況發生在您身上。使用合適的容器固定凝膠，不要在圖像圖像的途中過載。如果需要，最好進行多次旅行。

但是，如果您確實放棄了它，那麼一切都不會丟失。您也許可以根據應用，凝膠的損害程度以及拚圖技能來挽救凝膠！請記住要正確清理溢出物！

瓊脂糖凝膠錯誤總結了

那是我們的前5名瓊脂糖凝膠錯誤。雖然我們可能都犯了其中一些錯誤，但幸運的是，我們大多數人都不會讓這些事情不止一次。

您從瓊脂糖凝膠的不幸中學到了哪些教訓？在下麵的評論中讓我們知道。

參考

1. Upcroft JA。（1993）瓊脂糖對DNA電泳的性能的比較。J色譜。25; 618（1-2）：79-93

本文最初發表於2011年3月25日。審查並更新了2022年6月。