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天然凝膠與變性凝膠

天然凝膠與變性凝膠

我們已經講過了凝膠電泳工作原理,比較常見的凝膠類型瓊脂糖和聚丙烯酰胺甚至探索了一些選擇.現在我們來看看原生凝膠和變性凝膠。你很快就會成為一名speGEList !

變性凝膠

我們將從這個開始,因為它非常不言自明。變性凝膠就像標簽上寫的那樣:它們使你的DNA/RNA或蛋白質變性,分別生成一係列核酸或氨基酸。尿素通常用於DNA或RNA的變性,SDS-PAGE通常用於蛋白質。DMSO和乙二醛也可以用來使rna變性。

本機凝膠

哦,多麼可愛!這種凝膠的名字也很有幫助。原生凝膠以它們與生俱來的方式運行大分子,它們的結構沒有被破壞。

這種差異的含義是什麼?

由於變性凝膠運行的是已經變性成串的DNA、RNA和蛋白質,這些大分子通過凝膠的速度隻取決於它們的分子質量和固有電荷。通過一些小的修改(例如,在弦上塗上負電荷),你可以使它隻依賴於分子質量。相比之下,在天然凝膠中,大分子的整體體積或橫截麵積也是一個因素。原生凝膠更簡單,也更便宜,所以在可能的情況下,它們應該是你的首選凝膠類型。

那麼我怎麼知道該用哪種呢?

何時使用天然凝膠 何時使用變性凝膠
如果你不想打亂你序列的二級結構,例如,分離酶。 如果你在做西部印跡
如果你想知道你的樣本處於什麼層次狀態,例如,圓形或線性DNA。 測定樣品的純度
如果你需要根據它們的質量和總體體積來分離大分子。 為蛋白質測序做準備
研究蛋白質的結合 分離和分離結合在一起形成四元結構的大分子
如果你隻需要根據質量來分離大分子

你知道了吧!一些永恒的智慧,希望它們很容易遵循,像百吉餅一樣小!

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