安德魯·波特菲爾德
文章通過安德魯·波特菲爾德
個性化醫療的未來取決於負擔得起的DNA測序。為了爭奪1000美元的基因組，幾家測序儀製造商正致力於製造能夠更快、更準確地對DNA和RNA進行測序的設備。但到目前為止，隻有一家公司——總部位於加州聖地亞哥的Illumina——獲得了美國FDA監管機構的批準，可以使用它的…
在第一部分中，我回答了這個問題，“嗜熱生物中的蛋白質是如何在高溫下生存的?”在這一部分，我將看看核酸是如何在對我們大多數人來說太熱，但對一些生物來說很理想的條件下生存的，包括給我們Taq聚合酶和……
離子激流技術在2010年推出時，是有望徹底改變遺傳學的幾台機器之一。這些是台式機器，展示了他們在快速測序較小外顯子體和其他DNA樣本方麵的強大能力(每次運行大約1000 - 2000萬個堿基，而Illumina HiSeq一次可以讀取2500億個堿基)....
在最近的一次會議上，我向兩位分子生物學博士詢問他們上一次使用Southern blot是什麼時候。在將近一分鍾的開懷大笑之後，他們問道:“到底是誰還在這麼做?”“也許是一種非常、非常特殊的用途。”一位科學家猜測道。當我問那個教我…
從表麵上看，選擇一種酶(或一定量的酶)進行實驗似乎很容易。隻要看看標簽上的濃度，進行相應的調整，你就成功了。唉，不是用酶。用於測量酶的單位數量令人眼花繚亂。然而，現在它比…
BLAST不僅僅是測序數據爆炸式增長的雙關語，它使相似序列的注釋和比較變得更加容易。由美國國家生物技術信息中心的一個小組於1991年創建，基本局部對齊搜索工具可以說是使用最廣泛的序列分析工具(它是免費的，…
尋找足夠的資金來源是幾乎所有初創公司麵臨的主要挑戰，生物技術公司也不例外。事實上，製造一種新藥物或設備的監管、科學和後勤要求可能是任何行業中最具挑戰性的。此外，2007-2009年的全球經濟衰退(加上緊縮措施……
DNA測序(PCR, Sanger或下一代測序(NGS))現在是任何分子生物學實驗室熟悉的一部分。但被稱為“遺傳學灰姑娘”的“RNA-seq”現在正成為舞會上的美女，為這種“中心法則”中最核心的分子提供了新的見解。RNA有很多種，而基因組DNA是…
緩衝經常被認為是理所當然的，但它們可以成就或破壞一個實驗。在之前的文章中，我們已經討論了生物學研究中廣泛可用的緩衝器以及“好”緩衝器的特征。有機緩衝不是惰性的!它們可以與你的實驗分子相互作用，或者由於變化而改變pH值。
幾乎任何分子生物學實驗都會涉及到酶或其他活性蛋白質的作用。當酶參與進來時，實驗環境的pH值就會改變。這是因為大多數酶反應都涉及到氫離子(質子)的損失或獲得，這會改變環境的pH值。生物係統……
1845年至1852年間，愛爾蘭饑荒(如果你住在翡翠島以外，就叫“馬鈴薯大饑荒”)造成100萬人死亡，另有100萬人被迫離開愛爾蘭。這是由該國主要的糧食儲備——愛爾蘭“塊狀”土豆枯萎引起的。現在，研究人員已經確定了這種枯萎病的基因組……
每次實驗都使用美國類型培養集合(ATCC)參考菌株是很好的，但並不那麼實用。因此，大多數實驗室將細胞傳代到新的血管中。這種亞文化也被稱為“通道”。傳代數是指細胞培養中…
比較和測量基因表達當然是研究的一個組成部分——基因表達模式繼續向我們展示不同的細胞網絡是如何被調節的，並指出了新的生物途徑和疾病的可能治療方法。但基因表達的一個關鍵部分在於確保基因表達的差異是由基因…
耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA)持續困擾著世界各地的醫院。到目前為止，醫院(或醫療保健)MRSA (HA-MRSA)與社區中發現的MRSA具有不同的譜係。由於HA-MRSA無法在非醫院環境中存活，這使得事情變得相當方便。對HA-MRSA的檢測是常規的，分離株，特別是一種叫做ST22的菌株，可以很容易地…
質粒——構成生物技術最初基礎的細菌DNA環——在20世紀40年代和50年代不斷被發現。唯一的問題是，他們什麼都叫，就是沒有。一係列科學家發現了噬菌體和其他奇怪的體細胞DNA環，並給它們起了一係列的名字，包括:泛基因、生物母細胞、plasmagenes、plasogenes、choncriogenes、……
就在生命科技公司收購初創公司Ion Torrent之前，這家剛剛起步的公司正在處理另一種類型的洪流——全球媒體對其新測序技術的興趣，該技術承諾將下一代大規模並行測序的價格降至每運行1000美元。自從2011年夏天那個戲劇性的聲明之後，生命科技公司……
支原體是真核細胞培養中最難檢測的生物。它們可能是最危險的;它們可以破壞細胞的生長和分化，甚至凋亡模式，而你甚至不知道發生了什麼，直到為時已晚。傳統的細胞培養方法需要長達一個月的時間才能產生結果，這意味著……
當一位年輕的實驗室技術員把盤子從溫暖的房間裏拿出來時，他被盤子弄糊塗了。它們從來沒有這麼渾濁模糊過。他把它們拿給實驗室主任，主任悲傷地搖了搖頭。他們一起把盤子扔了。這個故事聽起來熟悉嗎?可能發生的事情太……
支原體感染是非常非常糟糕的消息;這些特殊的原核生物可以通過你的細胞培養快速傳播，抑製細胞增殖，誘導細胞凋亡，細胞因子和自由基，並以其他方式轉化你的細胞。最糟糕的是，由於汙染不容易發現，你可能沒有意識到你的文化被汙染了，直到為時已晚。100年……
我的一位前同事兼朋友在技術支持部門工作，負責接聽科學家的電話。這些電話大多來自那些因實驗失敗而受挫的生命科學研究人員。我的朋友會聽一會兒，然後幾乎總是用非常迷人但又帶著濃重的俄羅斯口音的英語大聲喊道:“不!你必須在實驗中加入緩衝液!它……
在回應我的上一篇文章《PCR背後的Taq》時，我們的一位讀者邦尼·巴裏洛(Bonnie Barrilleaux)問，DNA是否能在使其變性的溫度下自然存活。它也提出了一個問題;蛋白質是如何在如此高的溫度(55°C及以上)下保持完整並發揮作用的?事實證明，細胞會做很多…
諾貝爾獎得主卡裏·穆利斯(Kary Mullis)通常被認為是聚合酶鏈式反應的發明者，但他的發現在很大程度上要歸功於一位熱愛旅行的微生物學家，一些對溫泉中可以生活的假設的駁斥，以及黃石國家公園現已關閉的野外考察站。故事是這樣的。在20世紀60年代，托馬斯·布洛克是個……