詹姆斯·哈德菲爾德
詹姆斯有基因組學博士學位東安格利亞大學.一位經驗豐富的生命科學研究員和高級運營經理,在基因組學技術方麵有超過20年的經驗。具有領導科學、創新、領導實驗室團隊和管理重大年度預算的工作經驗。熟悉基因組學、轉錄組學和單細胞技術,關注癌症生物學;擅長識別和應用顛覆性科學創新。適應性合作者,革新者和企業家。基因組學的思想領袖,在學術界和產業界擁有廣泛的網絡,在各個層麵都能有效地工作。
文章通過詹姆斯·哈德菲爾德
本文討論了在使用瓊脂糖凝膠電泳進行NGS文庫大小選擇時需要考慮的一些重要問題。凝膠電泳是一種簡單且在大多數實驗室中非常常用的技術。小心!然而,這種簡單性意味著人們常常會忽略這樣一個事實:有些應用程序……
我們現在生活在1000美元基因組的時代。不幸的是,我們大多數人在獲取基因組或外顯子或RNA-seq讀取等量數據時,仍要付出比這多得多的代價。這個高於預期的價格有幾個原因,這篇文章旨在強調……
下一代測序(NGS)真的席卷了世界!在NGS中,數以百萬計的短讀在短時間內被排序,留給您大量的數據來分析!對於所有的NGS平台,輸入樣本(即您的細胞遊離DNA)必須被切割成短片段或片段,然後才能…
無論你是使用NGS進行全基因組測序,SNP變異分析,HLA分型,HLA匹配,甚至通過RNA-seq進行轉錄組或miRNA分析,大小選擇都是獲得最佳結果的一個非常重要的考慮因素。精確的尺寸選擇可以提高測序效率,節省資金,改善基因組組裝,以及…
你們小心翼翼地收集了樣本,提取了核酸,製作了第一套下一代測序庫。你如何知道你得到的數據是否有用,以及它是否值得你花力氣去學習如何進行分析?這該怪誰呢?幸運的是,有幾個……
桑格測序仍然是大多數分子生物學實驗室的主力。即使下一代測序技術的出現,我們仍然需要對克隆和PCR產物進行測序。在這篇文章中,我列出了我們在Sanger服務中使用的一些技巧和技巧。(1) BigDye的稀釋:我希望這是一個……
由於整個人類基因組測序相對容易,臨床研究人員對如何使用這項技術來幫助患者產生了興趣。過去有,現在仍有障礙需要克服——但希望是如此之大!離子激流技術是在一個小盒子裏,可以輕鬆坐在…
人類基因組計劃是成功的,但卻是艱苦的工作。該技術的主要改進是並行化和自動化的增加。2003年,就在HGP完成論文發表在《自然》和《科學》雜誌上時,ABI推出了“3730XL”。它可以每天運行24個96孔板,生成大約2 MB的序列。一些……
最早的測序方法是針對蛋白質開發的。1950年,Pehr Edman發表了一篇論文,演示了蛋白質測序的標簽切割方法,這種方法後來被稱為“Edman降解”。大約在同一時間,弗雷德·桑格正在開發他自己的標簽和分離方法,導致了胰島素的測序....
正如我們上周了解到的,人類基因組計劃是通過應用生物係統公司(ABI)改進的桑格方法和技術完成的。盡管這一“第一代”技術有了顯著的技術改進,但如果沒有範式的轉變,對多個人類基因組進行測序永遠不會容易。在過去的…
ChIP-seq是一項非常棒的技術,它允許我們使用下一代測序技術來研究蛋白質和DNA之間的物理結合相互作用。在這篇文章中,我將簡要介紹ChIP和染色質免疫沉澱測序技術(ChIP-seq),它結合了ChIP和下一代測序技術。什麼是染色質免疫沉澱?染色質免疫沉澱(ChIP)允許我們……