Sage Science為生命科學研究開發樣品製備技術。我們專注於電泳方法,改進和自動化下一代測序工作流程中的高價值步驟。
Sage銷售Pippin™係列DNA大小選擇儀器,廣泛用於DNA, RNA和ChIP-seq文庫建設,用於短讀測序。我們的係統也用於製備第三代高分子量DNA,遠程基因組學平台。
我們的產品在我們位於美國馬薩諸塞州貝弗利的總部生產。
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用於長讀測序的高分子量DNA的大小分析
了解如何使用電泳檢查長讀測序的DNA質量,以及為什麼仔細移液是如此重要。
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如何從線粒體中分離DNA:能量指南
線粒體DNA的分離既費時又費力。了解如何最小化提取所需的時間,同時確保出色的效果。
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下一代測序的DNA提取
下一代測序技術(NGS)的出現確實令人驚歎。一個經常被忽視的奇跡是DNA提取技術的進步如何幫助簡化NGS工作流程。最初的標準-苯酚/氯仿萃取-不太適合當今測序工作流程的自動化性質(盡管隨著…
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使用ddRAD-seq研究非模式生物
減少代表性基因組測序是過去幾年中最重要的進展之一,可以對沒有參考級基因組組裝的生物體進行大規模平行基因分型。一種被稱為ddRAD-seq的方法的實現,最初是在哈佛大學的Hoekstra實驗室提出的,已經被工廠和…
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NGS目標富集策略
下一代測序(NGS)開啟了一個了解基因組內部工作原理和功能的新時代。NGS允許研究人員觀察與個體基因差異或突變有關的特征,包括疾病。由於隻有大約1%的人類基因組構成了編碼蛋白質的基因,幾個…
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ChIP-seq工作流程運行最佳與自動DNA大小選擇
染色質免疫沉澱測序,更好地稱為ChIP-seq,是一種大規模並行方法,用於了解蛋白質和DNA之間的相互作用。這對於確定轉錄因子的活性尤其重要,這就是為什麼它經常被用來了解導致癌症的一係列複雜的生物學步驟。它也是許多表觀遺傳…
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從宏基因組測序中產生高質量的基因組組裝
在過去的十年中,基因組測序成本的下降激發了研究人員將霰彈槍下一代測序應用於整個微生物群落。雖然產生的reads通常不能整齊地組裝到單個基因組中,但通常會產生足夠的信息來識別種群中存在的大多數微生物。然而,這種方法缺乏足夠的解決方案來……
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crispr啟發的方法靶向大的,重複的DNA元素
多年來,通過PCR捕獲靶標一直是基因組學的主要手段,但研究重複、特征不明確或快速進化區域的科學家們仍在努力找出這些DNA片段以供進一步研究。然而,全基因組測序是這些地區唯一的另一種選擇,可能會迫使研究人員付出高昂的代價……
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基於ngs的HLA分型提供更全麵的信息
人類白細胞抗原(HLA)分型用於器官移植與供體的匹配和其他應用,正迅速從老式方法轉向NGS技術。這是向前邁出的重要一步,因為對高度多態性的HLA基因的更完整的觀點提供了對一個人的自然遺傳變異如何影響移植匹配的更深入的理解。
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利用新SageHLS平台提取HMW DNA進行遠程基因組分析
在DNA基因組測序被限製在短序列上的十年之後,新技術使科學家們有可能捕獲遠程遺傳信息,這些信息太大而無法在小的測序片段中檢測到。捕獲這些較大的DNA片段有助於發現和檢測臨床重要元素,如結構…
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大小選擇對無細胞DNA研究至關重要
使用無細胞DNA (cfDNA)來收集患者臨床有意義的信息的進展是驚人的。在大多數情況下,這些研究(或下遊診斷測試)將母親血液中的胎兒DNA或從血液中的健康DNA背景中分離出腫瘤來源的DNA。通常被稱為液體活檢,這些微創…
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為您的項目選擇最佳DNA大小選擇方法的三個見解
有這麼多選擇DNA大小的方法,確定哪一種最適合您的項目可能會令人困惑。幸運的是,學術研究人員已經評估了許多DNA大小選擇方法,用於一係列應用,他們的結論為社區提供了一些有用的見解。基於原限製性位點協議的雙文摘RAD-Seq
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自動電泳如何進行DNA大小選擇?
任何時候,隻要實驗室過程被複雜的科學儀器自動化,就會產生“黑匣子”效應,導致用戶想知道那裏發生了什麼。對於DNA電泳來說,沒有什麼不同。在手工凝膠中很容易看到發生了什麼,但基於凝膠的自動DNA大小選擇平台可能更神秘。自動化……
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DNA尺寸教程:何時使用手動凝膠,珠子等
在測序之前,有幾種選擇DNA片段大小的方法。你如何選擇最好的?下麵介紹各種選項,以及幫助您確定何時使用每種選項的注意事項。事實上,生物實驗室裏的每個學生都知道如何製備和切割手工凝膠,但它們無處不在……
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為了更好的NGS組裝,使用更精確的DNA大小選擇
像DNA大小選擇這樣的樣品製備步驟可能不會對下遊數據分析產生重大影響,但NGS用戶已經證明了這一點。事實上,你的大小選擇的精確性(或缺乏精確性)可以成就或破壞基因組組裝。考慮對端讀取的比對挑戰:…
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小rna的大小選擇藝術
大小選擇是NGS管道的關鍵步驟,但對於小rna的研究可能是最具挑戰性的。大小選擇背後的概念很簡單:根據片段大小分離剪切的DNA或cDNA樣本,然後使用得到的大小去除不需要的片段。這是一種可靠的方法來擺脫……
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SageELF用於NGS管道的全樣本分餾
在許多NGS工作流程中,您需要的不僅僅是DNA樣本的單個切片-但是大多數大小選擇方法很難挽救DNA的多個條帶或大小範圍。在處理珍貴的樣本或某些應用程序時,這一點尤其重要,因為在這些應用程序中,具有多個庫非常有用。
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對於長讀序列,大小選擇是關鍵
科學家們花了一段時間來適應長讀測序,但現在你不能用撬棍把他們中的大多數人從測序儀旁邊撬開。長序列——我們說的是10000個堿基或更多——在基因組組裝中提供了一定程度的連續性和完整性,這是短序列儀根本不可能做到的。他們……
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PippinHT的高通量DNA大小選擇
DNA大小的選擇是一項必要但費力不討好的任務。手工測定DNA的大小會讓人聯想到博士後花幾個小時擺弄凝膠,試圖以不可思議的精確度剪出特定的條帶。自動化DNA分級,雖然大大提高了大小選擇的精度和可重複性,但對於許多NGS實驗室來說,曆史上的通量太低,或者太不精確。
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為什麼DNA大小選擇在NGS管道中很重要
在下一代測序所需的所有樣品準備步驟中,DNA大小選擇可能對結果質量影響最大。畢竟,無效的施膠會浪費低分子量材料的測序能力,如適配器二聚體或引物二聚體,而不精確的施膠會阻礙生物信息學家產生準確的組裝。高品質的尺寸選擇可以…